Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms