Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcmt1P23506 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcmt1P23506 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms