Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnckQ9QYK9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms