Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD21O60216 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD21O60216 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD21O60216 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD21O60216 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD21O60216 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD21O60216 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD21O60216 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD21O60216 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD21O60216 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms