Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2E1P29083 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2E1P29083 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms