Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARID3CA6NKF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms