Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms