Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ARID3CA6NKF2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARID3CA6NKF2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms