Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms