Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BPC6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8BPC6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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