Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pfdn6Q03958 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms