Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Kif3aP28741 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Kif3aP28741 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms