Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bbip1J3QMK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms