Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc8E9PWG2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms