Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan11Q9D1D1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms