Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rassf9Q8K342 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rassf9Q8K342 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms