Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 snR64snR64 101 nt-1.3□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.3□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 YHR217CYHR217C 462 nt-1.3□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.33□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.34□□□□□ -2.62
PRP46Q12417 snR85snR85 171 nt-1.35□□□□□ -2.63
PRP46Q12417 YBL109WYBL109W 336 nt-1.4□□□□□ -2.63
PRP46Q12417 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.41□□□□□ -2.64
PRP46Q12417 YOR309CYOR309C 381 nt-1.41□□□□□ -2.64
PRP46Q12417 snR6snR6 112 nt-1.45□□□□□ -2.64
PRP46Q12417 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.47□□□□□ -2.64
PRP46Q12417 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.51□□□□□ -2.65
PRP46Q12417 snR73snR73 106 nt-1.58□□□□□ -2.66
PRP46Q12417 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.62□□□□□ -2.67
PRP46Q12417 snR53snR53 91 nt-1.63□□□□□ -2.67
PRP46Q12417 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.69□□□□□ -2.68
PRP46Q12417 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.8□□□□□ -2.7
PRP46Q12417 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.87□□□□□ -2.71
PRP46Q12417 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.05□□□□□ -2.74
PRP46Q12417 snR40snR40 97 nt-2.12□□□□□ -2.75
PRP46Q12417 snR58snR58 96 nt-2.21□□□□□ -2.76
PRP46Q12417 snR87snR87 109 nt-2.23□□□□□ -2.77
PRP46Q12417 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.43□□□□□ -2.8
PRP46Q12417 YDR543CYDR543C 300 nt-2.51□□□□□ -2.81
PRP46Q12417 snR75snR75 89 nt-2.67□□□□□ -2.84
PRP46Q12417 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.77□□□□□ -2.85
PRP46Q12417 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.51□□□□□ -2.97
PRP46Q12417 YJR162CYJR162C 351 nt-3.64□□□□□ -2.99
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.3 ms