Protein–RNA interactions for Protein: Q12379

SWM1, Anaphase-promoting complex subunit SWM1, yeastyeast

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWM1Q12379 snR161snR161 161 nt-0.22□□□□□ -2.44
SWM1Q12379 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.23□□□□□ -2.45
SWM1Q12379 snR75snR75 89 nt-0.35□□□□□ -2.47
SWM1Q12379 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.44□□□□□ -2.48
SWM1Q12379 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.58□□□□□ -2.5
SWM1Q12379 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
SWM1Q12379 snR40snR40 97 nt-0.63□□□□□ -2.51
SWM1Q12379 snR6snR6 112 nt-0.64□□□□□ -2.51
SWM1Q12379 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.68□□□□□ -2.52
SWM1Q12379 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
SWM1Q12379 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.75□□□□□ -2.53
SWM1Q12379 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.77□□□□□ -2.53
SWM1Q12379 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
SWM1Q12379 snR73snR73 106 nt-0.85□□□□□ -2.55
SWM1Q12379 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
SWM1Q12379 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
SWM1Q12379 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
SWM1Q12379 YOR309CYOR309C 381 nt-1.04□□□□□ -2.58
SWM1Q12379 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.13□□□□□ -2.59
SWM1Q12379 snR58snR58 96 nt-1.27□□□□□ -2.61
SWM1Q12379 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.28□□□□□ -2.61
SWM1Q12379 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.29□□□□□ -2.62
SWM1Q12379 YNR077CYNR077C 255 nt-1.31□□□□□ -2.62
SWM1Q12379 snR87snR87 109 nt-1.58□□□□□ -2.66
SWM1Q12379 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.2□□□□□ -2.76
SWM1Q12379 YDR543CYDR543C 300 nt-2.63□□□□□ -2.83
SWM1Q12379 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.87□□□□□ -2.87
SWM1Q12379 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.35□□□□□ -2.95
SWM1Q12379 YJR162CYJR162C 351 nt-3.76□□□□□ -3.01
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms