Protein–RNA interactions for Protein: Q12373

HIF1, HAT1-interacting factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HIF1Q12373 YMR326CYMR326C 309 nt-1.37□□□□□ -2.63
HIF1Q12373 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.41□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 snR64snR64 101 nt-1.42□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 YHR217CYHR217C 462 nt-1.42□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.45□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.45□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 snR85snR85 171 nt-1.46□□□□□ -2.64
HIF1Q12373 YBL109WYBL109W 336 nt-1.49□□□□□ -2.65
HIF1Q12373 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.51□□□□□ -2.65
HIF1Q12373 YOR309CYOR309C 381 nt-1.54□□□□□ -2.66
HIF1Q12373 snR6snR6 112 nt-1.55□□□□□ -2.66
HIF1Q12373 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.57□□□□□ -2.66
HIF1Q12373 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.6□□□□□ -2.67
HIF1Q12373 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.69□□□□□ -2.68
HIF1Q12373 snR73snR73 106 nt-1.72□□□□□ -2.68
HIF1Q12373 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.74□□□□□ -2.69
HIF1Q12373 snR53snR53 91 nt-1.8□□□□□ -2.7
HIF1Q12373 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.87□□□□□ -2.71
HIF1Q12373 YDR543CYDR543C 300 nt-1.92□□□□□ -2.72
HIF1Q12373 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.95□□□□□ -2.72
HIF1Q12373 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.05□□□□□ -2.74
HIF1Q12373 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.25□□□□□ -2.77
HIF1Q12373 snR40snR40 97 nt-2.32□□□□□ -2.78
HIF1Q12373 snR87snR87 109 nt-2.44□□□□□ -2.8
HIF1Q12373 snR58snR58 96 nt-2.46□□□□□ -2.8
HIF1Q12373 YJR162CYJR162C 351 nt-2.69□□□□□ -2.84
HIF1Q12373 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.71□□□□□ -2.84
HIF1Q12373 snR75snR75 89 nt-2.94□□□□□ -2.88
HIF1Q12373 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.36□□□□□ -2.95
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4.1 ms