Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.75□□□□□ -2.69
VAM3Q12241 YHR217CYHR217C 462 nt-1.76□□□□□ -2.69
VAM3Q12241 snR64snR64 101 nt-1.77□□□□□ -2.69
VAM3Q12241 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.8□□□□□ -2.7
VAM3Q12241 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.84□□□□□ -2.7
VAM3Q12241 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.85□□□□□ -2.71
VAM3Q12241 snR85snR85 171 nt-1.88□□□□□ -2.71
VAM3Q12241 snR6snR6 112 nt-1.94□□□□□ -2.72
VAM3Q12241 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.95□□□□□ -2.72
VAM3Q12241 YOR309CYOR309C 381 nt-1.95□□□□□ -2.72
VAM3Q12241 YBL109WYBL109W 336 nt-2□□□□□ -2.73
VAM3Q12241 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.01□□□□□ -2.73
VAM3Q12241 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.03□□□□□ -2.73
VAM3Q12241 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.14□□□□□ -2.75
VAM3Q12241 snR73snR73 106 nt-2.15□□□□□ -2.75
VAM3Q12241 snR53snR53 91 nt-2.17□□□□□ -2.76
VAM3Q12241 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.22□□□□□ -2.76
VAM3Q12241 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.27□□□□□ -2.77
VAM3Q12241 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.43□□□□□ -2.8
VAM3Q12241 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.52□□□□□ -2.81
VAM3Q12241 YDR543CYDR543C 300 nt-2.87□□□□□ -2.87
VAM3Q12241 snR58snR58 96 nt-2.88□□□□□ -2.87
VAM3Q12241 snR40snR40 97 nt-2.88□□□□□ -2.87
VAM3Q12241 snR87snR87 109 nt-3.03□□□□□ -2.89
VAM3Q12241 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.22□□□□□ -2.92
VAM3Q12241 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.4□□□□□ -2.95
VAM3Q12241 snR75snR75 89 nt-3.6□□□□□ -2.99
VAM3Q12241 YJR162CYJR162C 351 nt-3.9□□□□□ -3.03
VAM3Q12241 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.29□□□□□ -3.1
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