Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 snR77snR77 88 nt-0.23□□□□□ -2.45
PUF2Q12221 snR161snR161 161 nt-0.23□□□□□ -2.45
PUF2Q12221 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.28□□□□□ -2.45
PUF2Q12221 URB1YKL014C 5295 nt-0.43□□□□□ -2.48
PUF2Q12221 snR75snR75 89 nt-0.52□□□□□ -2.49
PUF2Q12221 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 YNR077CYNR077C 255 nt-0.55□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.59□□□□□ -2.5
PUF2Q12221 snR6snR6 112 nt-0.64□□□□□ -2.51
PUF2Q12221 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.67□□□□□ -2.52
PUF2Q12221 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.67□□□□□ -2.52
PUF2Q12221 snR40snR40 97 nt-0.68□□□□□ -2.52
PUF2Q12221 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.71□□□□□ -2.52
PUF2Q12221 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
PUF2Q12221 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.78□□□□□ -2.53
PUF2Q12221 snR73snR73 106 nt-0.81□□□□□ -2.54
PUF2Q12221 YOR309CYOR309C 381 nt-0.94□□□□□ -2.56
PUF2Q12221 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.08□□□□□ -2.58
PUF2Q12221 snR58snR58 96 nt-1.13□□□□□ -2.59
PUF2Q12221 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.18□□□□□ -2.6
PUF2Q12221 snR87snR87 109 nt-1.42□□□□□ -2.64
PUF2Q12221 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.49□□□□□ -2.65
PUF2Q12221 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.56□□□□□ -2.66
PUF2Q12221 YDR543CYDR543C 300 nt-1.8□□□□□ -2.7
PUF2Q12221 YJR162CYJR162C 351 nt-2.61□□□□□ -2.83
PUF2Q12221 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.84□□□□□ -2.86
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 299.7 ms