Protein–RNA interactions for Protein: Q12189

RKI1, Ribose-5-phosphate isomerase, yeastyeast

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKI1Q12189 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.41□□□□□ -2.48
RKI1Q12189 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.47□□□□□ -2.48
RKI1Q12189 URB1YKL014C 5295 nt-0.57□□□□□ -2.5
RKI1Q12189 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.59□□□□□ -2.5
RKI1Q12189 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
RKI1Q12189 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
RKI1Q12189 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RKI1Q12189 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RKI1Q12189 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RKI1Q12189 snR75snR75 89 nt-0.74□□□□□ -2.53
RKI1Q12189 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.8□□□□□ -2.54
RKI1Q12189 snR6snR6 112 nt-0.82□□□□□ -2.54
RKI1Q12189 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
RKI1Q12189 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.85□□□□□ -2.55
RKI1Q12189 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.86□□□□□ -2.55
RKI1Q12189 snR40snR40 97 nt-0.88□□□□□ -2.55
RKI1Q12189 snR73snR73 106 nt-1.02□□□□□ -2.57
RKI1Q12189 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.05□□□□□ -2.58
RKI1Q12189 YNR077CYNR077C 255 nt-1.11□□□□□ -2.59
RKI1Q12189 YOR309CYOR309C 381 nt-1.14□□□□□ -2.59
RKI1Q12189 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.2□□□□□ -2.6
RKI1Q12189 snR58snR58 96 nt-1.39□□□□□ -2.63
RKI1Q12189 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.48□□□□□ -2.65
RKI1Q12189 snR87snR87 109 nt-1.72□□□□□ -2.68
RKI1Q12189 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.77□□□□□ -2.69
RKI1Q12189 YDR543CYDR543C 300 nt-2.38□□□□□ -2.79
RKI1Q12189 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.51□□□□□ -2.81
RKI1Q12189 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.22□□□□□ -2.92
RKI1Q12189 YJR162CYJR162C 351 nt-3.29□□□□□ -2.94
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.1 ms