Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 snR33snR33 183 nt-0.65□□□□□ -2.51
SSF2Q12153 snR77snR77 88 nt-0.73□□□□□ -2.53
SSF2Q12153 snR53snR53 91 nt-0.73□□□□□ -2.53
SSF2Q12153 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.74□□□□□ -2.53
SSF2Q12153 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
SSF2Q12153 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.81□□□□□ -2.54
SSF2Q12153 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.81□□□□□ -2.54
SSF2Q12153 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.86□□□□□ -2.55
SSF2Q12153 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.89□□□□□ -2.55
SSF2Q12153 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.91□□□□□ -2.56
SSF2Q12153 YNR077CYNR077C 255 nt-0.94□□□□□ -2.56
SSF2Q12153 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.07□□□□□ -2.58
SSF2Q12153 snR6snR6 112 nt-1.09□□□□□ -2.58
SSF2Q12153 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.1□□□□□ -2.59
SSF2Q12153 YOR309CYOR309C 381 nt-1.19□□□□□ -2.6
SSF2Q12153 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.21□□□□□ -2.6
SSF2Q12153 snR73snR73 106 nt-1.23□□□□□ -2.61
SSF2Q12153 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
SSF2Q12153 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.39□□□□□ -2.63
SSF2Q12153 snR40snR40 97 nt-1.51□□□□□ -2.65
SSF2Q12153 snR75snR75 89 nt-1.79□□□□□ -2.7
SSF2Q12153 snR58snR58 96 nt-1.82□□□□□ -2.7
SSF2Q12153 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
SSF2Q12153 snR87snR87 109 nt-1.87□□□□□ -2.71
SSF2Q12153 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.96□□□□□ -2.72
SSF2Q12153 YDR543CYDR543C 300 nt-2.02□□□□□ -2.73
SSF2Q12153 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.03□□□□□ -2.73
SSF2Q12153 YJR162CYJR162C 351 nt-3.02□□□□□ -2.89
SSF2Q12153 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.23□□□□□ -2.93
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.9 ms