Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.65□□□□□ -2.67
SLM3Q12093 Q0092Q0092 141 nt-1.68□□□□□ -2.68
SLM3Q12093 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.69□□□□□ -2.68
SLM3Q12093 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.71□□□□□ -2.68
SLM3Q12093 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.71□□□□□ -2.68
SLM3Q12093 Q0143Q0143 153 nt-1.73□□□□□ -2.69
SLM3Q12093 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.75□□□□□ -2.69
SLM3Q12093 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.76□□□□□ -2.69
SLM3Q12093 snR64snR64 101 nt-1.77□□□□□ -2.69
SLM3Q12093 YMR326CYMR326C 309 nt-1.77□□□□□ -2.69
SLM3Q12093 snR73snR73 106 nt-1.79□□□□□ -2.7
SLM3Q12093 snR85snR85 171 nt-1.79□□□□□ -2.7
SLM3Q12093 YHR217CYHR217C 462 nt-1.88□□□□□ -2.71
SLM3Q12093 YDR543CYDR543C 300 nt-1.99□□□□□ -2.73
SLM3Q12093 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.99□□□□□ -2.73
SLM3Q12093 YBL109WYBL109W 336 nt-2.14□□□□□ -2.75
SLM3Q12093 snR53snR53 91 nt-2.16□□□□□ -2.76
SLM3Q12093 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.18□□□□□ -2.76
SLM3Q12093 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.25□□□□□ -2.77
SLM3Q12093 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.28□□□□□ -2.77
SLM3Q12093 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.31□□□□□ -2.78
SLM3Q12093 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.32□□□□□ -2.78
SLM3Q12093 snR87snR87 109 nt-2.47□□□□□ -2.8
SLM3Q12093 snR58snR58 96 nt-2.48□□□□□ -2.81
SLM3Q12093 snR40snR40 97 nt-2.55□□□□□ -2.82
SLM3Q12093 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.78□□□□□ -2.85
SLM3Q12093 YJR162CYJR162C 351 nt-2.87□□□□□ -2.87
SLM3Q12093 snR75snR75 89 nt-3.3□□□□□ -2.94
SLM3Q12093 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.72□□□□□ -3
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