Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 snR77snR77 88 nt-0.47□□□□□ -2.48
NIC96P34077 URB1YKL014C 5295 nt-0.57□□□□□ -2.5
NIC96P34077 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.59□□□□□ -2.5
NIC96P34077 snR33snR33 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
NIC96P34077 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
NIC96P34077 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.72□□□□□ -2.52
NIC96P34077 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
NIC96P34077 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.82□□□□□ -2.54
NIC96P34077 snR6snR6 112 nt-0.85□□□□□ -2.55
NIC96P34077 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.89□□□□□ -2.55
NIC96P34077 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
NIC96P34077 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
NIC96P34077 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
NIC96P34077 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.98□□□□□ -2.57
NIC96P34077 snR73snR73 106 nt-1.03□□□□□ -2.57
NIC96P34077 snR40snR40 97 nt-1.08□□□□□ -2.58
NIC96P34077 snR75snR75 89 nt-1.09□□□□□ -2.58
NIC96P34077 YOR309CYOR309C 381 nt-1.11□□□□□ -2.59
NIC96P34077 YNR077CYNR077C 255 nt-1.19□□□□□ -2.6
NIC96P34077 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.19□□□□□ -2.6
NIC96P34077 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
NIC96P34077 snR58snR58 96 nt-1.52□□□□□ -2.65
NIC96P34077 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.6□□□□□ -2.67
NIC96P34077 snR87snR87 109 nt-1.7□□□□□ -2.68
NIC96P34077 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.06□□□□□ -2.74
NIC96P34077 YDR543CYDR543C 300 nt-2.73□□□□□ -2.85
NIC96P34077 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.92□□□□□ -2.88
NIC96P34077 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.25□□□□□ -2.93
NIC96P34077 YJR162CYJR162C 351 nt-4.03□□□□□ -3.05
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms