Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2E1P29083 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2E1P29083 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms