Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms