Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YOR102WYOR102W 351 nt0.3□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 RCO1YMR075W 2055 nt0.29□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 YNL337WYNL337W 255 nt0.29□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.29□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 snR39BsnR39B 96 nt0.29□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 YGR151CYGR151C 336 nt0.28□□□□□ -2.36
RTP1Q12751 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 snR48snR48 113 nt0.26□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.24□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.23□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 YBR099CYBR099C 384 nt0.23□□□□□ -2.37
RTP1Q12751 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.21□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 YNL338WYNL338W 159 nt0.21□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.2□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.19□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 YBL053WYBL053W 375 nt0.19□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.18□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 EST1YLR233C 2100 nt0.17□□□□□ -2.38
RTP1Q12751 snR45snR45 172 nt0.15□□□□□ -2.39
RTP1Q12751 Q0032Q0032 291 nt0.1□□□□□ -2.39
RTP1Q12751 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.1□□□□□ -2.39
RTP1Q12751 RPM2YML091C 3609 nt0.08□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.08□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 YNL205CYNL205C 423 nt0.08□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 snR69snR69 101 nt0.07□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.07□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 snR128snR128 126 nt0.07□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 PMP2YEL017C-A 132 nt0.06□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 SOV1YMR066W 2697 nt0.05□□□□□ -2.4
RTP1Q12751 YGR164WYGR164W 336 nt0.02□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 SOM1YEL059C-A 225 nt0□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 RDS3YPR094W 324 nt0□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 SEC10YLR166C 2616 nt-0.01□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 YBR178WYBR178W 375 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTP1Q12751 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTP1Q12751 YNL266WYNL266W 420 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTP1Q12751 YOR225WYOR225W 330 nt-0.08□□□□□ -2.42
RTP1Q12751 YLR294CYLR294C 330 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 snR50snR50 90 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTP1Q12751 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.16□□□□□ -2.44
RTP1Q12751 SBH2YER019C-A 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTP1Q12751 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.2□□□□□ -2.44
RTP1Q12751 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.21□□□□□ -2.44
RTP1Q12751 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.21□□□□□ -2.44
RTP1Q12751 snR67snR67 82 nt-0.29□□□□□ -2.46
RTP1Q12751 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.34□□□□□ -2.46
RTP1Q12751 YNL170WYNL170W 396 nt-0.34□□□□□ -2.46
RTP1Q12751 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.38□□□□□ -2.47
RTP1Q12751 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTP1Q12751 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTP1Q12751 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.4□□□□□ -2.47
RTP1Q12751 ATP8Q0080 147 nt-0.44□□□□□ -2.48
RTP1Q12751 SKI7YOR076C 2244 nt-0.48□□□□□ -2.49
RTP1Q12751 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.5□□□□□ -2.49
RTP1Q12751 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.52□□□□□ -2.49
RTP1Q12751 URB1YKL014C 5295 nt-0.53□□□□□ -2.49
RTP1Q12751 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.55□□□□□ -2.5
RTP1Q12751 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.55□□□□□ -2.5
RTP1Q12751 snR81snR81 201 nt-0.56□□□□□ -2.5
RTP1Q12751 Q0092Q0092 141 nt-0.58□□□□□ -2.5
RTP1Q12751 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.6□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 RPL41AYDL184C 78 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 snR61snR61 90 nt-0.62□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 snR47snR47 99 nt-0.63□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 snR161snR161 161 nt-0.64□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.65□□□□□ -2.51
RTP1Q12751 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.67□□□□□ -2.52
RTP1Q12751 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.68□□□□□ -2.52
RTP1Q12751 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
RTP1Q12751 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.74□□□□□ -2.53
RTP1Q12751 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.79□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 Q0143Q0143 153 nt-0.8□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.81□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.81□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 snR38snR38 95 nt-0.81□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
RTP1Q12751 YNR077CYNR077C 255 nt-0.86□□□□□ -2.55
RTP1Q12751 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.89□□□□□ -2.55
RTP1Q12751 YKL225WYKL225W 348 nt-0.92□□□□□ -2.56
RTP1Q12751 snR62snR62 100 nt-0.93□□□□□ -2.56
RTP1Q12751 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.94□□□□□ -2.56
RTP1Q12751 YMR326CYMR326C 309 nt-0.96□□□□□ -2.56
RTP1Q12751 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.96□□□□□ -2.56
RTP1Q12751 snR85snR85 171 nt-1.01□□□□□ -2.57
RTP1Q12751 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.06□□□□□ -2.58
RTP1Q12751 snR77snR77 88 nt-1.07□□□□□ -2.58
RTP1Q12751 YHR217CYHR217C 462 nt-1.07□□□□□ -2.58
RTP1Q12751 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.11□□□□□ -2.59
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