Protein–RNA interactions for Protein: Q12734

CSR2, Transcription factor CSR2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSR2Q12734 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.87□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 YSP1YHR155W 3687 nt0.87□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 SBH1YER087C-B 249 nt0.86□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 RKR1YMR247C 4689 nt0.85□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 snR45snR45 172 nt0.84□□□□□ -2.27
CSR2Q12734 ULP2YIL031W 3105 nt0.84□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 BUL2YML111W 2763 nt0.84□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 BEM3YPL115C 3387 nt0.83□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.82□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YNL266WYNL266W 420 nt0.82□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.82□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.81□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 NNF2YGR089W 2811 nt0.8□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 AI1Q0050 2505 nt0.8□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 FMP27YLR454W 7887 nt0.79□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.79□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.78□□□□□ -2.28
CSR2Q12734 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.77□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 GLG1YKR058W 1851 nt0.76□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 LTE1YAL024C 4308 nt0.75□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.75□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 RPS26AYGL189C 360 nt0.73□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.73□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.72□□□□□ -2.29
CSR2Q12734 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.71□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 IQG1YPL242C 4488 nt0.71□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 SEC10YLR166C 2616 nt0.7□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.7□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 EST1YLR233C 2100 nt0.7□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 snR62snR62 100 nt0.69□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.69□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 ORC3YLL004W 1851 nt0.69□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 THO2YNL139C 4794 nt0.68□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.68□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.66□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 NIP1YMR309C 2439 nt0.66□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 CSE1YGL238W 2883 nt0.66□□□□□ -2.3
CSR2Q12734 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.65□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 snR47snR47 99 nt0.65□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 snR69snR69 101 nt0.64□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.64□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.64□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 PET111YMR257C 2403 nt0.63□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 MLP2YIL149C 5040 nt0.62□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
CSR2Q12734 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.58□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.57□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.56□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 MLP1YKR095W 5628 nt0.55□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.55□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 RDS3YPR094W 324 nt0.55□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.53□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 snR50snR50 90 nt0.53□□□□□ -2.32
CSR2Q12734 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.51□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 snR38snR38 95 nt0.51□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.51□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 snR64snR64 101 nt0.47□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.47□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 YKL225WYKL225W 348 nt0.47□□□□□ -2.33
CSR2Q12734 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.44□□□□□ -2.34
CSR2Q12734 RPL41AYDL184C 78 nt0.43□□□□□ -2.34
CSR2Q12734 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.43□□□□□ -2.34
CSR2Q12734 snR53snR53 91 nt0.41□□□□□ -2.34
CSR2Q12734 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.4□□□□□ -2.35
CSR2Q12734 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.38□□□□□ -2.35
CSR2Q12734 ESP1YGR098C 4893 nt0.38□□□□□ -2.35
CSR2Q12734 snR67snR67 82 nt0.32□□□□□ -2.36
CSR2Q12734 SKI7YOR076C 2244 nt0.3□□□□□ -2.36
CSR2Q12734 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.29□□□□□ -2.36
CSR2Q12734 SOV1YMR066W 2697 nt0.29□□□□□ -2.36
CSR2Q12734 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.25□□□□□ -2.37
CSR2Q12734 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.24□□□□□ -2.37
CSR2Q12734 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
CSR2Q12734 YJL113WYJL113W 4647 nt0.18□□□□□ -2.38
CSR2Q12734 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.17□□□□□ -2.38
CSR2Q12734 snR128snR128 126 nt0.16□□□□□ -2.38
CSR2Q12734 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.16□□□□□ -2.38
CSR2Q12734 PAU9YBL108C-A 129 nt0.13□□□□□ -2.39
CSR2Q12734 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.09□□□□□ -2.4
CSR2Q12734 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.08□□□□□ -2.4
CSR2Q12734 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.07□□□□□ -2.4
CSR2Q12734 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.01□□□□□ -2.41
CSR2Q12734 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0□□□□□ -2.41
CSR2Q12734 snR77snR77 88 nt-0.01□□□□□ -2.41
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