Protein–RNA interactions for Protein: Q12477

PCL9, PHO85 cyclin-9, yeastyeast

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCL9Q12477 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.08□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 YJL150WYJL150W 303 nt0.06□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 EST1YLR233C 2100 nt0.06□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 snR39BsnR39B 96 nt0.06□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 snR48snR48 113 nt0.06□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 THO2YNL139C 4794 nt0.05□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.05□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 QCR9YGR183C 201 nt0.05□□□□□ -2.4
PCL9Q12477 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.01□□□□□ -2.41
PCL9Q12477 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.01□□□□□ -2.41
PCL9Q12477 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0□□□□□ -2.41
PCL9Q12477 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.01□□□□□ -2.41
PCL9Q12477 YOR102WYOR102W 351 nt-0.04□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.05□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 snR128snR128 126 nt-0.05□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.06□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 YNL198CYNL198C 303 nt-0.07□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 YGR164WYGR164W 336 nt-0.08□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 snR45snR45 172 nt-0.08□□□□□ -2.42
PCL9Q12477 snR69snR69 101 nt-0.1□□□□□ -2.43
PCL9Q12477 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.1□□□□□ -2.43
PCL9Q12477 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.1□□□□□ -2.43
PCL9Q12477 YBL053WYBL053W 375 nt-0.11□□□□□ -2.43
PCL9Q12477 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.12□□□□□ -2.43
PCL9Q12477 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.16□□□□□ -2.44
PCL9Q12477 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.17□□□□□ -2.44
PCL9Q12477 YNL205CYNL205C 423 nt-0.17□□□□□ -2.44
PCL9Q12477 RDS3YPR094W 324 nt-0.2□□□□□ -2.44
PCL9Q12477 SEC10YLR166C 2616 nt-0.22□□□□□ -2.44
PCL9Q12477 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.23□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.24□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.24□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 YGR151CYGR151C 336 nt-0.24□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.25□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 snR50snR50 90 nt-0.28□□□□□ -2.45
PCL9Q12477 SBH2YER019C-A 267 nt-0.29□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YBR178WYBR178W 375 nt-0.29□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YNL266WYNL266W 420 nt-0.3□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YNL337WYNL337W 255 nt-0.3□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YNL338WYNL338W 159 nt-0.3□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.32□□□□□ -2.46
PCL9Q12477 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.36□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.36□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.38□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.39□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 Q0032Q0032 291 nt-0.4□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.4□□□□□ -2.47
PCL9Q12477 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.42□□□□□ -2.48
PCL9Q12477 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.42□□□□□ -2.48
PCL9Q12477 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.42□□□□□ -2.48
PCL9Q12477 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.44□□□□□ -2.48
PCL9Q12477 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.47□□□□□ -2.48
PCL9Q12477 snR67snR67 82 nt-0.48□□□□□ -2.49
PCL9Q12477 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.5□□□□□ -2.49
PCL9Q12477 URB1YKL014C 5295 nt-0.51□□□□□ -2.49
PCL9Q12477 SKI7YOR076C 2244 nt-0.56□□□□□ -2.5
PCL9Q12477 YOR225WYOR225W 330 nt-0.56□□□□□ -2.5
PCL9Q12477 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.63□□□□□ -2.51
PCL9Q12477 YLR294CYLR294C 330 nt-0.65□□□□□ -2.51
PCL9Q12477 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
PCL9Q12477 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.7□□□□□ -2.52
PCL9Q12477 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
PCL9Q12477 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
PCL9Q12477 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
PCL9Q12477 snR161snR161 161 nt-0.73□□□□□ -2.53
PCL9Q12477 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.74□□□□□ -2.53
PCL9Q12477 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.74□□□□□ -2.53
PCL9Q12477 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.74□□□□□ -2.53
PCL9Q12477 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.81□□□□□ -2.54
PCL9Q12477 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.83□□□□□ -2.54
PCL9Q12477 snR81snR81 201 nt-0.84□□□□□ -2.54
PCL9Q12477 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.86□□□□□ -2.55
PCL9Q12477 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.87□□□□□ -2.55
PCL9Q12477 YNL170WYNL170W 396 nt-0.87□□□□□ -2.55
PCL9Q12477 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.89□□□□□ -2.55
PCL9Q12477 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.91□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 RPL41AYDL184C 78 nt-0.92□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 snR38snR38 95 nt-0.94□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 snR77snR77 88 nt-0.95□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.95□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 snR47snR47 99 nt-0.96□□□□□ -2.56
PCL9Q12477 ATP8Q0080 147 nt-0.98□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 snR61snR61 90 nt-1.01□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.01□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.01□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.02□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.03□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.03□□□□□ -2.57
PCL9Q12477 YNR077CYNR077C 255 nt-1.09□□□□□ -2.58
PCL9Q12477 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.1□□□□□ -2.59
PCL9Q12477 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.12□□□□□ -2.59
PCL9Q12477 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.16□□□□□ -2.6
PCL9Q12477 YKL225WYKL225W 348 nt-1.2□□□□□ -2.6
PCL9Q12477 Q0092Q0092 141 nt-1.22□□□□□ -2.6
PCL9Q12477 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.25□□□□□ -2.61
PCL9Q12477 snR62snR62 100 nt-1.26□□□□□ -2.61
PCL9Q12477 Q0143Q0143 153 nt-1.29□□□□□ -2.62
PCL9Q12477 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.29□□□□□ -2.62
PCL9Q12477 YOR309CYOR309C 381 nt-1.38□□□□□ -2.63
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