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Protein–RNA interactions for Protein: Q12334
SCM3, Protein SCM3, yeast
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223 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SCM3
Q12334
snR80
snR80
171 nt
-0.24
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
snR46
snR46
197 nt
-0.25
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
YGR164W
YGR164W
336 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
snR39B
snR39B
96 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
snR52
snR52
92 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
SCM3
Q12334
YLR342W-A
YLR342W-A
174 nt
-0.29
□□□□□ -2.46
SCM3
Q12334
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
SCM3
Q12334
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
SCM3
Q12334
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
SCM3
Q12334
SEC10
YLR166C
2616 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
SCM3
Q12334
snR69
snR69
101 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
SCM3
Q12334
YPL060C-A
YPL060C-A
3315 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
SCM3
Q12334
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
SCM3
Q12334
YDR406W-A
YDR406W-A
246 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
SCM3
Q12334
PMP2
YEL017C-A
132 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
RDS3
YPR094W
324 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YML100W-A
YML100W-A
174 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
snR48
snR48
113 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YER090C-A
YER090C-A
90 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YOR102W
YOR102W
351 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
SCM3
Q12334
YNL205C
YNL205C
423 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
YDL007C-A
YDL007C-A
258 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
snR50
snR50
90 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tL(UAA)Q
tL(UAA)Q
85 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
YNL266W
YNL266W
420 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
SCM3
Q12334
YBR178W
YBR178W
375 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
SCM3
Q12334
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
SCM3
Q12334
JLP2
YMR132C
627 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
SCM3
Q12334
snR161
snR161
161 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
SCM3
Q12334
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
SCM3
Q12334
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
SCM3
Q12334
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
SCM3
Q12334
snR67
snR67
82 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCM3
Q12334
YNL198C
YNL198C
303 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
SCM3
Q12334
YJL150W
YJL150W
303 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
SCM3
Q12334
SPG3
YDR504C
384 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCM3
Q12334
snR33
snR33
183 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCM3
Q12334
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCM3
Q12334
YLR299C-A
YLR299C-A
93 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCM3
Q12334
SOM1
YEL059C-A
225 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SCM3
Q12334
tM(CAU)Q1
tM(CAU)Q1
76 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SCM3
Q12334
YBL053W
YBL053W
375 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
SCM3
Q12334
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCM3
Q12334
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
SCM3
Q12334
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCM3
Q12334
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCM3
Q12334
YLR466C-B
YLR466C-B
117 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
SCM3
Q12334
YHR180C-B
YHR180C-B
105 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
SCM3
Q12334
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.88
□□□□□ -2.55
SCM3
Q12334
YGR151C
YGR151C
336 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
SCM3
Q12334
YML054C-A
YML054C-A
159 nt
-0.89
□□□□□ -2.55
SCM3
Q12334
YNR077C
YNR077C
255 nt
-0.91
□□□□□ -2.56
SCM3
Q12334
YNL338W
YNL338W
159 nt
-0.95
□□□□□ -2.56
SCM3
Q12334
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
-1.03
□□□□□ -2.57
SCM3
Q12334
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-1.04
□□□□□ -2.58
SCM3
Q12334
YNL337W
YNL337W
255 nt
-1.07
□□□□□ -2.58
SCM3
Q12334
YOL083C-A
YOL083C-A
141 nt
-1.08
□□□□□ -2.58
SCM3
Q12334
RPL41A
YDL184C
78 nt
-1.12
□□□□□ -2.59
SCM3
Q12334
YOR376W-A
YOR376W-A
156 nt
-1.13
□□□□□ -2.59
SCM3
Q12334
YGR240C-A
YGR240C-A
201 nt
-1.15
□□□□□ -2.59
SCM3
Q12334
YKL106C-A
YKL106C-A
120 nt
-1.15
□□□□□ -2.59
SCM3
Q12334
YBR296C-A
YBR296C-A
120 nt
-1.15
□□□□□ -2.59
SCM3
Q12334
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
-1.18
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
YOL164W-A
YOL164W-A
183 nt
-1.19
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
Q0032
Q0032
291 nt
-1.2
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
YBR109W-A
YBR109W-A
225 nt
-1.2
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
YAL037C-A
YAL037C-A
93 nt
-1.21
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
-1.21
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-1.22
□□□□□ -2.6
SCM3
Q12334
snR77
snR77
88 nt
-1.25
□□□□□ -2.61
SCM3
Q12334
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-1.25
□□□□□ -2.61
SCM3
Q12334
snR47
snR47
99 nt
-1.26
□□□□□ -2.61
SCM3
Q12334
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.27
□□□□□ -2.61
SCM3
Q12334
YGL007C-A
YGL007C-A
87 nt
-1.29
□□□□□ -2.62
SCM3
Q12334
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-1.3
□□□□□ -2.62
SCM3
Q12334
snR81
snR81
201 nt
-1.32
□□□□□ -2.62
SCM3
Q12334
snR38
snR38
95 nt
-1.34
□□□□□ -2.62
SCM3
Q12334
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
-1.46
□□□□□ -2.64
SCM3
Q12334
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
86 nt
-1.48
□□□□□ -2.65
SCM3
Q12334
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
-1.5
□□□□□ -2.65
SCM3
Q12334
YKL225W
YKL225W
348 nt
-1.51
□□□□□ -2.65
SCM3
Q12334
snR61
snR61
90 nt
-1.52
□□□□□ -2.65
SCM3
Q12334
YLR294C
YLR294C
330 nt
-1.52
□□□□□ -2.65
SCM3
Q12334
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-1.54
□□□□□ -2.66
SCM3
Q12334
YNL170W
YNL170W
396 nt
-1.59
□□□□□ -2.66
SCM3
Q12334
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-1.61
□□□□□ -2.67
SCM3
Q12334
YOR225W
YOR225W
330 nt
-1.61
□□□□□ -2.67
SCM3
Q12334
YOR309C
YOR309C
381 nt
-1.68
□□□□□ -2.68
SCM3
Q12334
YDL114W-A
YDL114W-A
114 nt
-1.69
□□□□□ -2.68
SCM3
Q12334
snR62
snR62
100 nt
-1.7
□□□□□ -2.68
SCM3
Q12334
RPL41B
YDL133C-A
78 nt
-1.75
□□□□□ -2.69
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