Protein–RNA interactions for Protein: Q12306

SMT3, Ubiquitin-like protein SMT3, yeast

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMT3	Q12306	snR69	snR69	101 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
SMT3	Q12306	snR39B	snR39B	96 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
SMT3	Q12306	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMT3	Q12306	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMT3	Q12306	snR52	snR52	92 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMT3	Q12306	QCR9	YGR183C	201 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	snR46	snR46	197 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMT3	Q12306	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	snR50	snR50	90 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	Q0142	Q0142	177 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMT3	Q12306	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMT3	Q12306	snR48	snR48	113 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMT3	Q12306	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMT3	Q12306	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SMT3	Q12306	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SMT3	Q12306	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SMT3	Q12306	YJL150W	YJL150W	303 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SMT3	Q12306	YNL198C	YNL198C	303 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SMT3	Q12306	snR67	snR67	82 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SMT3	Q12306	YBL053W	YBL053W	375 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SMT3	Q12306	snR33	snR33	183 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SMT3	Q12306	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SMT3	Q12306	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
SMT3	Q12306	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SMT3	Q12306	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SMT3	Q12306	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SMT3	Q12306	SPG3	YDR504C	384 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SMT3	Q12306	snR161	snR161	161 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SMT3	Q12306	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
SMT3	Q12306	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SMT3	Q12306	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMT3	Q12306	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMT3	Q12306	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMT3	Q12306	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SMT3	Q12306	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
SMT3	Q12306	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
SMT3	Q12306	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
SMT3	Q12306	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
SMT3	Q12306	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
SMT3	Q12306	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
SMT3	Q12306	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
SMT3	Q12306	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
SMT3	Q12306	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SMT3	Q12306	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
SMT3	Q12306	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
SMT3	Q12306	snR77	snR77	88 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
SMT3	Q12306	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SMT3	Q12306	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
SMT3	Q12306	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
SMT3	Q12306	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
SMT3	Q12306	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
SMT3	Q12306	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMT3	Q12306	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
SMT3	Q12306	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SMT3	Q12306	snR38	snR38	95 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SMT3	Q12306	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
SMT3	Q12306	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
SMT3	Q12306	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
SMT3	Q12306	snR47	snR47	99 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
SMT3	Q12306	snR81	snR81	201 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
SMT3	Q12306	YNL337W	YNL337W	255 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
SMT3	Q12306	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
SMT3	Q12306	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
SMT3	Q12306	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
SMT3	Q12306	Q0032	Q0032	291 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
SMT3	Q12306	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
SMT3	Q12306	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
SMT3	Q12306	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
SMT3	Q12306	YKL225W	YKL225W	348 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
SMT3	Q12306	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
SMT3	Q12306	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
SMT3	Q12306	snR61	snR61	90 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
SMT3	Q12306	YLR294C	YLR294C	330 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
SMT3	Q12306	YOR225W	YOR225W	330 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
SMT3	Q12306	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
SMT3	Q12306	snR6	snR6	112 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
SMT3	Q12306	YNL170W	YNL170W	396 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
SMT3	Q12306	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
SMT3	Q12306	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
SMT3	Q12306	snR62	snR62	100 nt		-2	□□□□□ -2.73
SMT3	Q12306	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2	□□□□□ -2.73

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