Protein–RNA interactions for Protein: Q12286

SUT2, Sterol uptake protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUT2Q12286 GLG1YKR058W 1851 nt1.22□□□□□ -2.21
SUT2Q12286 FYV8YGR196C 2454 nt1.22□□□□□ -2.21
SUT2Q12286 SEC3YER008C 4011 nt1.21□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.21□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 NNF2YGR089W 2811 nt1.21□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 UTP20YBL004W 7482 nt1.2□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 PET127YOR017W 2403 nt1.18□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.18□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 YOL014WYOL014W 375 nt1.17□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 ULP2YIL031W 3105 nt1.16□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 CSE1YGL238W 2883 nt1.16□□□□□ -2.22
SUT2Q12286 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.15□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 MYO1YHR023W 5787 nt1.14□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 EST1YLR233C 2100 nt1.12□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 snR69snR69 101 nt1.12□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.12□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 SPT7YBR081C 3999 nt1.11□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 snR53snR53 91 nt1.11□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 ORC3YLL004W 1851 nt1.11□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 snR64snR64 101 nt1.1□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.09□□□□□ -2.23
SUT2Q12286 RDS3YPR094W 324 nt1.08□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 snR50snR50 90 nt1.08□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.05□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.05□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 NIP1YMR309C 2439 nt1.03□□□□□ -2.24
SUT2Q12286 YMR160WYMR160W 2451 nt1.02□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.01□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YKL225WYKL225W 348 nt1.01□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.01□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 BUL2YML111W 2763 nt1.01□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 RPL41AYDL184C 78 nt0.99□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.99□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 YPR117WYPR117W 7470 nt0.97□□□□□ -2.25
SUT2Q12286 BEM2YER155C 6504 nt0.95□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.94□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.94□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.91□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 VAM6YDL077C 3150 nt0.91□□□□□ -2.26
SUT2Q12286 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.88□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 SCC2YDR180W 4482 nt0.87□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 SKI7YOR076C 2244 nt0.86□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 AI1Q0050 2505 nt0.85□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
SUT2Q12286 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.83□□□□□ -2.28
SUT2Q12286 snR38snR38 95 nt0.83□□□□□ -2.28
SUT2Q12286 LTE1YAL024C 4308 nt0.83□□□□□ -2.28
SUT2Q12286 PET111YMR257C 2403 nt0.83□□□□□ -2.28
SUT2Q12286 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.79□□□□□ -2.28
SUT2Q12286 snR67snR67 82 nt0.76□□□□□ -2.29
SUT2Q12286 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.76□□□□□ -2.29
SUT2Q12286 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.74□□□□□ -2.29
SUT2Q12286 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.72□□□□□ -2.29
SUT2Q12286 FMP27YLR454W 7887 nt0.72□□□□□ -2.29
SUT2Q12286 MLP1YKR095W 5628 nt0.68□□□□□ -2.3
SUT2Q12286 IQG1YPL242C 4488 nt0.64□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.63□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 MLP2YIL149C 5040 nt0.62□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 snR75snR75 89 nt0.61□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.59□□□□□ -2.31
SUT2Q12286 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
SUT2Q12286 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.57□□□□□ -2.32
SUT2Q12286 THO2YNL139C 4794 nt0.57□□□□□ -2.32
SUT2Q12286 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.56□□□□□ -2.32
SUT2Q12286 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.55□□□□□ -2.32
SUT2Q12286 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.46□□□□□ -2.34
SUT2Q12286 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.43□□□□□ -2.34
SUT2Q12286 ESP1YGR098C 4893 nt0.42□□□□□ -2.34
SUT2Q12286 SOV1YMR066W 2697 nt0.41□□□□□ -2.34
SUT2Q12286 PAU9YBL108C-A 129 nt0.37□□□□□ -2.35
SUT2Q12286 snR128snR128 126 nt0.36□□□□□ -2.35
SUT2Q12286 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.32□□□□□ -2.36
SUT2Q12286 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.32□□□□□ -2.36
SUT2Q12286 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.28□□□□□ -2.36
SUT2Q12286 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.27□□□□□ -2.37
SUT2Q12286 SBH2YER019C-A 267 nt0.25□□□□□ -2.37
SUT2Q12286 snR77snR77 88 nt0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.2 ms