Protein–RNA interactions for Protein: Q12144

PER33, Pore and endoplasmic reticulum protein of 33 kDa, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PER33Q12144 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.58□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YOR170WYOR170W 306 nt-0.58□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.58□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.59□□□□□ -2.5
PER33Q12144 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.6□□□□□ -2.51
PER33Q12144 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.62□□□□□ -2.51
PER33Q12144 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.64□□□□□ -2.51
PER33Q12144 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.65□□□□□ -2.51
PER33Q12144 snR69snR69 101 nt-0.67□□□□□ -2.52
PER33Q12144 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.67□□□□□ -2.52
PER33Q12144 YOR302WYOR302W 78 nt-0.68□□□□□ -2.52
PER33Q12144 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.7□□□□□ -2.52
PER33Q12144 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.73□□□□□ -2.53
PER33Q12144 snR39BsnR39B 96 nt-0.75□□□□□ -2.53
PER33Q12144 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.76□□□□□ -2.53
PER33Q12144 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.77□□□□□ -2.53
PER33Q12144 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.77□□□□□ -2.53
PER33Q12144 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.78□□□□□ -2.53
PER33Q12144 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.78□□□□□ -2.53
PER33Q12144 RDS3YPR094W 324 nt-0.78□□□□□ -2.53
PER33Q12144 snR50snR50 90 nt-0.78□□□□□ -2.53
PER33Q12144 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.8□□□□□ -2.54
PER33Q12144 YNL266WYNL266W 420 nt-0.8□□□□□ -2.54
PER33Q12144 snR33snR33 183 nt-0.8□□□□□ -2.54
PER33Q12144 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
PER33Q12144 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
PER33Q12144 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.83□□□□□ -2.54
PER33Q12144 snR48snR48 113 nt-0.83□□□□□ -2.54
PER33Q12144 snR80snR80 171 nt-0.9□□□□□ -2.55
PER33Q12144 JLP2YMR132C 627 nt-0.9□□□□□ -2.55
PER33Q12144 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.92□□□□□ -2.56
PER33Q12144 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.94□□□□□ -2.56
PER33Q12144 YBR178WYBR178W 375 nt-0.94□□□□□ -2.56
PER33Q12144 snR52snR52 92 nt-0.95□□□□□ -2.56
PER33Q12144 snR67snR67 82 nt-0.96□□□□□ -2.56
PER33Q12144 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.96□□□□□ -2.56
PER33Q12144 YNL205CYNL205C 423 nt-0.96□□□□□ -2.56
PER33Q12144 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.97□□□□□ -2.56
PER33Q12144 snR161snR161 161 nt-0.99□□□□□ -2.57
PER33Q12144 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.01□□□□□ -2.57
PER33Q12144 YOR102WYOR102W 351 nt-1.05□□□□□ -2.58
PER33Q12144 SKI7YOR076C 2244 nt-1.06□□□□□ -2.58
PER33Q12144 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.07□□□□□ -2.58
PER33Q12144 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.14□□□□□ -2.59
PER33Q12144 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.16□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.17□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YNR077CYNR077C 255 nt-1.18□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.19□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.2□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.22□□□□□ -2.6
PER33Q12144 YNL198CYNL198C 303 nt-1.25□□□□□ -2.61
PER33Q12144 Q0142Q0142 177 nt-1.27□□□□□ -2.61
PER33Q12144 YJL150WYJL150W 303 nt-1.27□□□□□ -2.61
PER33Q12144 YBL053WYBL053W 375 nt-1.34□□□□□ -2.62
PER33Q12144 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.37□□□□□ -2.63
PER33Q12144 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.38□□□□□ -2.63
PER33Q12144 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.39□□□□□ -2.63
PER33Q12144 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.4□□□□□ -2.63
PER33Q12144 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.4□□□□□ -2.63
PER33Q12144 snR77snR77 88 nt-1.43□□□□□ -2.64
PER33Q12144 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.44□□□□□ -2.64
PER33Q12144 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.48□□□□□ -2.65
PER33Q12144 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.52□□□□□ -2.65
PER33Q12144 SPG3YDR504C 384 nt-1.53□□□□□ -2.65
PER33Q12144 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.54□□□□□ -2.66
PER33Q12144 snR81snR81 201 nt-1.56□□□□□ -2.66
PER33Q12144 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.57□□□□□ -2.66
PER33Q12144 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.63□□□□□ -2.67
PER33Q12144 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.63□□□□□ -2.67
PER33Q12144 RPL41AYDL184C 78 nt-1.65□□□□□ -2.67
PER33Q12144 YGR151CYGR151C 336 nt-1.66□□□□□ -2.68
PER33Q12144 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.66□□□□□ -2.68
PER33Q12144 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.66□□□□□ -2.68
PER33Q12144 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.68□□□□□ -2.68
PER33Q12144 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.75□□□□□ -2.69
PER33Q12144 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.77□□□□□ -2.69
PER33Q12144 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.77□□□□□ -2.69
PER33Q12144 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.8□□□□□ -2.7
PER33Q12144 snR38snR38 95 nt-1.8□□□□□ -2.7
PER33Q12144 snR47snR47 99 nt-1.84□□□□□ -2.7
PER33Q12144 YOR309CYOR309C 381 nt-1.86□□□□□ -2.71
PER33Q12144 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.87□□□□□ -2.71
PER33Q12144 YNL338WYNL338W 159 nt-1.88□□□□□ -2.71
PER33Q12144 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.9□□□□□ -2.71
PER33Q12144 YNL337WYNL337W 255 nt-2.03□□□□□ -2.73
PER33Q12144 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.08□□□□□ -2.74
PER33Q12144 snR6snR6 112 nt-2.11□□□□□ -2.75
PER33Q12144 YKL225WYKL225W 348 nt-2.12□□□□□ -2.75
PER33Q12144 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.16□□□□□ -2.76
PER33Q12144 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.18□□□□□ -2.76
PER33Q12144 Q0032Q0032 291 nt-2.19□□□□□ -2.76
PER33Q12144 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.2□□□□□ -2.76
PER33Q12144 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.22□□□□□ -2.76
PER33Q12144 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.24□□□□□ -2.77
PER33Q12144 snR73snR73 106 nt-2.25□□□□□ -2.77
PER33Q12144 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.28□□□□□ -2.77
PER33Q12144 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.29□□□□□ -2.78
PER33Q12144 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.33□□□□□ -2.78
PER33Q12144 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.33□□□□□ -2.78
PER33Q12144 snR85snR85 171 nt-2.35□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms