Protein–RNA interactions for Protein: Q12118

SGT2, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGT2Q12118 YOR170WYOR170W 306 nt0.03□□□□□ -2.4
SGT2Q12118 SOV1YMR066W 2697 nt0.03□□□□□ -2.4
SGT2Q12118 JLP2YMR132C 627 nt0.01□□□□□ -2.41
SGT2Q12118 snR39BsnR39B 96 nt0.01□□□□□ -2.41
SGT2Q12118 SPG3YDR504C 384 nt-0.01□□□□□ -2.41
SGT2Q12118 snR128snR128 126 nt-0.01□□□□□ -2.41
SGT2Q12118 YJL150WYJL150W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
SGT2Q12118 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.04□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.07□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.07□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 snR48snR48 113 nt-0.07□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 YGR164WYGR164W 336 nt-0.08□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 YOR102WYOR102W 351 nt-0.08□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.09□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.09□□□□□ -2.42
SGT2Q12118 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.1□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 YNL198CYNL198C 303 nt-0.1□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 YBL053WYBL053W 375 nt-0.11□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.12□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 snR69snR69 101 nt-0.13□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.15□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.15□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.15□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.15□□□□□ -2.43
SGT2Q12118 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.16□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 RPM2YML091C 3609 nt-0.19□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.2□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 YNL205CYNL205C 423 nt-0.21□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 RDS3YPR094W 324 nt-0.21□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.22□□□□□ -2.44
SGT2Q12118 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.23□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YBR178WYBR178W 375 nt-0.23□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 snR50snR50 90 nt-0.23□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 SEC10YLR166C 2616 nt-0.24□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.26□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YGR151CYGR151C 336 nt-0.26□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.27□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YNL338WYNL338W 159 nt-0.27□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.28□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YNL266WYNL266W 420 nt-0.28□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.28□□□□□ -2.45
SGT2Q12118 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.3□□□□□ -2.46
SGT2Q12118 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.33□□□□□ -2.46
SGT2Q12118 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.34□□□□□ -2.46
SGT2Q12118 YNL337WYNL337W 255 nt-0.38□□□□□ -2.47
SGT2Q12118 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.38□□□□□ -2.47
SGT2Q12118 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.39□□□□□ -2.47
SGT2Q12118 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.42□□□□□ -2.48
SGT2Q12118 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.42□□□□□ -2.48
SGT2Q12118 snR67snR67 82 nt-0.44□□□□□ -2.48
SGT2Q12118 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.47□□□□□ -2.48
SGT2Q12118 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.51□□□□□ -2.49
SGT2Q12118 Q0032Q0032 291 nt-0.52□□□□□ -2.49
SGT2Q12118 SKI7YOR076C 2244 nt-0.52□□□□□ -2.49
SGT2Q12118 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.56□□□□□ -2.5
SGT2Q12118 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
SGT2Q12118 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.6□□□□□ -2.51
SGT2Q12118 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.64□□□□□ -2.51
SGT2Q12118 snR161snR161 161 nt-0.65□□□□□ -2.51
SGT2Q12118 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.67□□□□□ -2.52
SGT2Q12118 YOR225WYOR225W 330 nt-0.68□□□□□ -2.52
SGT2Q12118 YLR294CYLR294C 330 nt-0.69□□□□□ -2.52
SGT2Q12118 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.7□□□□□ -2.52
SGT2Q12118 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
SGT2Q12118 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.76□□□□□ -2.53
SGT2Q12118 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
SGT2Q12118 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
SGT2Q12118 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
SGT2Q12118 RPL41AYDL184C 78 nt-0.79□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.79□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.79□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 snR81snR81 201 nt-0.8□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 snR47snR47 99 nt-0.82□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.83□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YNL170WYNL170W 396 nt-0.84□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.84□□□□□ -2.54
SGT2Q12118 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.85□□□□□ -2.55
SGT2Q12118 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.89□□□□□ -2.55
SGT2Q12118 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.89□□□□□ -2.55
SGT2Q12118 snR38snR38 95 nt-0.89□□□□□ -2.55
SGT2Q12118 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.9□□□□□ -2.55
SGT2Q12118 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.91□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.91□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.96□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 snR61snR61 90 nt-0.97□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 ATP8Q0080 147 nt-0.97□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 YNR077CYNR077C 255 nt-0.97□□□□□ -2.56
SGT2Q12118 snR77snR77 88 nt-0.98□□□□□ -2.57
SGT2Q12118 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.01□□□□□ -2.57
SGT2Q12118 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.04□□□□□ -2.58
SGT2Q12118 YKL225WYKL225W 348 nt-1.08□□□□□ -2.58
SGT2Q12118 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.08□□□□□ -2.58
SGT2Q12118 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.1□□□□□ -2.59
SGT2Q12118 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.14□□□□□ -2.59
SGT2Q12118 Q0092Q0092 141 nt-1.17□□□□□ -2.6
SGT2Q12118 snR62snR62 100 nt-1.19□□□□□ -2.6
SGT2Q12118 Q0143Q0143 153 nt-1.23□□□□□ -2.61
SGT2Q12118 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.32□□□□□ -2.62
SGT2Q12118 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms