Protein–RNA interactions for Protein: Q03648

YMR209C, Uncharacterized protein YMR209C, yeastyeast

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR209CQ03648 snR46snR46 197 nt-0.46□□□□□ -2.48
YMR209CQ03648 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.47□□□□□ -2.48
YMR209CQ03648 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.48□□□□□ -2.49
YMR209CQ03648 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.51□□□□□ -2.49
YMR209CQ03648 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.51□□□□□ -2.49
YMR209CQ03648 snR69snR69 101 nt-0.54□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 SEC10YLR166C 2616 nt-0.54□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.55□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.55□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.56□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 snR39BsnR39B 96 nt-0.58□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.59□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.59□□□□□ -2.5
YMR209CQ03648 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.61□□□□□ -2.51
YMR209CQ03648 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
YMR209CQ03648 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.62□□□□□ -2.51
YMR209CQ03648 snR80snR80 171 nt-0.63□□□□□ -2.51
YMR209CQ03648 snR48snR48 113 nt-0.65□□□□□ -2.51
YMR209CQ03648 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.66□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 RDS3YPR094W 324 nt-0.66□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.69□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 snR52snR52 92 nt-0.7□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.71□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.71□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 YNL266WYNL266W 420 nt-0.72□□□□□ -2.52
YMR209CQ03648 snR50snR50 90 nt-0.73□□□□□ -2.53
YMR209CQ03648 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.75□□□□□ -2.53
YMR209CQ03648 JLP2YMR132C 627 nt-0.76□□□□□ -2.53
YMR209CQ03648 YNL205CYNL205C 423 nt-0.77□□□□□ -2.53
YMR209CQ03648 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.78□□□□□ -2.53
YMR209CQ03648 Q0142Q0142 177 nt-0.79□□□□□ -2.54
YMR209CQ03648 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.85□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 YOR102WYOR102W 351 nt-0.85□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.86□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 YBR178WYBR178W 375 nt-0.86□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 snR33snR33 183 nt-0.87□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 snR67snR67 82 nt-0.89□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.89□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.9□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.9□□□□□ -2.55
YMR209CQ03648 SKI7YOR076C 2244 nt-0.98□□□□□ -2.57
YMR209CQ03648 YNL198CYNL198C 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
YMR209CQ03648 YJL150WYJL150W 303 nt-1□□□□□ -2.57
YMR209CQ03648 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.04□□□□□ -2.58
YMR209CQ03648 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.05□□□□□ -2.58
YMR209CQ03648 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.06□□□□□ -2.58
YMR209CQ03648 YBL053WYBL053W 375 nt-1.09□□□□□ -2.58
YMR209CQ03648 snR161snR161 161 nt-1.09□□□□□ -2.58
YMR209CQ03648 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.15□□□□□ -2.59
YMR209CQ03648 SPG3YDR504C 384 nt-1.18□□□□□ -2.6
YMR209CQ03648 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.18□□□□□ -2.6
YMR209CQ03648 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.21□□□□□ -2.6
YMR209CQ03648 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.22□□□□□ -2.6
YMR209CQ03648 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.23□□□□□ -2.61
YMR209CQ03648 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.26□□□□□ -2.61
YMR209CQ03648 YNR077CYNR077C 255 nt-1.31□□□□□ -2.62
YMR209CQ03648 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.33□□□□□ -2.62
YMR209CQ03648 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.42□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.43□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.46□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 snR77snR77 88 nt-1.47□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 YGR151CYGR151C 336 nt-1.47□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.47□□□□□ -2.64
YMR209CQ03648 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.53□□□□□ -2.65
YMR209CQ03648 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.56□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YNL338WYNL338W 159 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.58□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.58□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.59□□□□□ -2.66
YMR209CQ03648 RPL41AYDL184C 78 nt-1.61□□□□□ -2.67
YMR209CQ03648 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.64□□□□□ -2.67
YMR209CQ03648 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.66□□□□□ -2.68
YMR209CQ03648 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.66□□□□□ -2.68
YMR209CQ03648 snR38snR38 95 nt-1.67□□□□□ -2.68
YMR209CQ03648 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.69□□□□□ -2.68
YMR209CQ03648 snR81snR81 201 nt-1.72□□□□□ -2.68
YMR209CQ03648 YNL337WYNL337W 255 nt-1.75□□□□□ -2.69
YMR209CQ03648 Q0032Q0032 291 nt-1.79□□□□□ -2.7
YMR209CQ03648 snR47snR47 99 nt-1.79□□□□□ -2.7
YMR209CQ03648 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.83□□□□□ -2.7
YMR209CQ03648 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.87□□□□□ -2.71
YMR209CQ03648 YOR309CYOR309C 381 nt-1.99□□□□□ -2.73
YMR209CQ03648 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.03□□□□□ -2.73
YMR209CQ03648 YKL225WYKL225W 348 nt-2.04□□□□□ -2.74
YMR209CQ03648 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-2.09□□□□□ -2.74
YMR209CQ03648 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-2.11□□□□□ -2.75
YMR209CQ03648 snR61snR61 90 nt-2.12□□□□□ -2.75
YMR209CQ03648 snR6snR6 112 nt-2.15□□□□□ -2.75
YMR209CQ03648 YLR294CYLR294C 330 nt-2.22□□□□□ -2.76
YMR209CQ03648 YOR225WYOR225W 330 nt-2.23□□□□□ -2.77
YMR209CQ03648 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-2.24□□□□□ -2.77
YMR209CQ03648 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.24□□□□□ -2.77
YMR209CQ03648 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.25□□□□□ -2.77
YMR209CQ03648 snR62snR62 100 nt-2.27□□□□□ -2.77
YMR209CQ03648 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.29□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms