Protein–RNA interactions for Protein: P53897

IGO1, mRNA stability protein IGO1, yeastyeast

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IGO1P53897 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 AI1Q0050 2505 nt0.68□□□□□ -2.3
IGO1P53897 PAN2YGL094C 3348 nt0.67□□□□□ -2.3
IGO1P53897 YCS4YLR272C 3531 nt0.67□□□□□ -2.3
IGO1P53897 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.67□□□□□ -2.3
IGO1P53897 KAP120YPL125W 3099 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 SEC1YDR164C 2175 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 CSE1YGL238W 2883 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 YNL266WYNL266W 420 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 ASE1YOR058C 2658 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 ALY2YJL084C 3141 nt0.66□□□□□ -2.3
IGO1P53897 snR81snR81 201 nt0.65□□□□□ -2.31
IGO1P53897 SWI4YER111C 3282 nt0.65□□□□□ -2.31
IGO1P53897 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.64□□□□□ -2.31
IGO1P53897 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.64□□□□□ -2.31
IGO1P53897 snR45snR45 172 nt0.63□□□□□ -2.31
IGO1P53897 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.61□□□□□ -2.31
IGO1P53897 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.61□□□□□ -2.31
IGO1P53897 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.6□□□□□ -2.31
IGO1P53897 SEC8YPR055W 3198 nt0.6□□□□□ -2.31
IGO1P53897 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.59□□□□□ -2.31
IGO1P53897 SBH1YER087C-B 249 nt0.58□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.58□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.58□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.58□□□□□ -2.32
IGO1P53897 SEC10YLR166C 2616 nt0.57□□□□□ -2.32
IGO1P53897 LTE1YAL024C 4308 nt0.57□□□□□ -2.32
IGO1P53897 EST1YLR233C 2100 nt0.56□□□□□ -2.32
IGO1P53897 MLP2YIL149C 5040 nt0.56□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.56□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.56□□□□□ -2.32
IGO1P53897 NNF2YGR089W 2811 nt0.55□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.55□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.55□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.55□□□□□ -2.32
IGO1P53897 IQG1YPL242C 4488 nt0.55□□□□□ -2.32
IGO1P53897 NIP1YMR309C 2439 nt0.54□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.54□□□□□ -2.32
IGO1P53897 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.54□□□□□ -2.32
IGO1P53897 snR47snR47 99 nt0.54□□□□□ -2.32
IGO1P53897 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.53□□□□□ -2.32
IGO1P53897 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.53□□□□□ -2.32
IGO1P53897 GLG1YKR058W 1851 nt0.52□□□□□ -2.33
IGO1P53897 snR69snR69 101 nt0.5□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.5□□□□□ -2.33
IGO1P53897 RPS26AYGL189C 360 nt0.5□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YSP1YHR155W 3687 nt0.5□□□□□ -2.33
IGO1P53897 snR62snR62 100 nt0.49□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.49□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.49□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.49□□□□□ -2.33
IGO1P53897 FMP27YLR454W 7887 nt0.49□□□□□ -2.33
IGO1P53897 UTP10YJL109C 5310 nt0.48□□□□□ -2.33
IGO1P53897 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.47□□□□□ -2.33
IGO1P53897 ORC3YLL004W 1851 nt0.47□□□□□ -2.33
IGO1P53897 PET111YMR257C 2403 nt0.46□□□□□ -2.34
IGO1P53897 RDS3YPR094W 324 nt0.45□□□□□ -2.34
IGO1P53897 snR50snR50 90 nt0.44□□□□□ -2.34
IGO1P53897 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.43□□□□□ -2.34
IGO1P53897 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.43□□□□□ -2.34
IGO1P53897 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.41□□□□□ -2.34
IGO1P53897 RPM2YML091C 3609 nt0.4□□□□□ -2.35
IGO1P53897 RPL41AYDL184C 78 nt0.37□□□□□ -2.35
IGO1P53897 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.36□□□□□ -2.35
IGO1P53897 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.36□□□□□ -2.35
IGO1P53897 YKL225WYKL225W 348 nt0.35□□□□□ -2.35
IGO1P53897 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.34□□□□□ -2.36
IGO1P53897 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.34□□□□□ -2.36
IGO1P53897 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.33□□□□□ -2.36
IGO1P53897 snR64snR64 101 nt0.32□□□□□ -2.36
IGO1P53897 snR38snR38 95 nt0.31□□□□□ -2.36
IGO1P53897 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.3□□□□□ -2.36
IGO1P53897 snR67snR67 82 nt0.26□□□□□ -2.37
IGO1P53897 SKI7YOR076C 2244 nt0.25□□□□□ -2.37
IGO1P53897 PAU9YBL108C-A 129 nt0.22□□□□□ -2.37
IGO1P53897 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
IGO1P53897 snR53snR53 91 nt0.21□□□□□ -2.38
IGO1P53897 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.2□□□□□ -2.38
IGO1P53897 snR128snR128 126 nt0.2□□□□□ -2.38
IGO1P53897 MLP1YKR095W 5628 nt0.16□□□□□ -2.38
IGO1P53897 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.14□□□□□ -2.39
IGO1P53897 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.14□□□□□ -2.39
IGO1P53897 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.12□□□□□ -2.39
IGO1P53897 YNR077CYNR077C 255 nt0.11□□□□□ -2.39
IGO1P53897 SOV1YMR066W 2697 nt0.09□□□□□ -2.39
IGO1P53897 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.09□□□□□ -2.4
IGO1P53897 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.4
IGO1P53897 ESP1YGR098C 4893 nt0.09□□□□□ -2.4
IGO1P53897 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.08□□□□□ -2.4
IGO1P53897 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.04□□□□□ -2.4
IGO1P53897 SBH2YER019C-A 267 nt-0.01□□□□□ -2.41
IGO1P53897 snR161snR161 161 nt-0.02□□□□□ -2.41
IGO1P53897 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.04□□□□□ -2.42
IGO1P53897 snR77snR77 88 nt-0.05□□□□□ -2.42
IGO1P53897 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.05□□□□□ -2.42
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