Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 EST1YLR233C 2100 nt0.01□□□□□ -2.41
VID27P40157 YDR210WYDR210W 228 nt0□□□□□ -2.41
VID27P40157 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0□□□□□ -2.41
VID27P40157 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.01□□□□□ -2.41
VID27P40157 snR128snR128 126 nt-0.04□□□□□ -2.42
VID27P40157 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.06□□□□□ -2.42
VID27P40157 snR48snR48 113 nt-0.06□□□□□ -2.42
VID27P40157 SPG3YDR504C 384 nt-0.07□□□□□ -2.42
VID27P40157 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.07□□□□□ -2.42
VID27P40157 snR39BsnR39B 96 nt-0.07□□□□□ -2.42
VID27P40157 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.1□□□□□ -2.43
VID27P40157 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.12□□□□□ -2.43
VID27P40157 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.13□□□□□ -2.43
VID27P40157 JLP2YMR132C 627 nt-0.16□□□□□ -2.44
VID27P40157 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.2□□□□□ -2.44
VID27P40157 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.2□□□□□ -2.44
VID27P40157 YOR102WYOR102W 351 nt-0.2□□□□□ -2.44
VID27P40157 YGR164WYGR164W 336 nt-0.21□□□□□ -2.44
VID27P40157 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.23□□□□□ -2.45
VID27P40157 snR69snR69 101 nt-0.23□□□□□ -2.45
VID27P40157 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.24□□□□□ -2.45
VID27P40157 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.24□□□□□ -2.45
VID27P40157 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.25□□□□□ -2.45
VID27P40157 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.26□□□□□ -2.45
VID27P40157 YJL150WYJL150W 303 nt-0.26□□□□□ -2.45
VID27P40157 YNL205CYNL205C 423 nt-0.27□□□□□ -2.45
VID27P40157 SBH2YER019C-A 267 nt-0.28□□□□□ -2.45
VID27P40157 RDS3YPR094W 324 nt-0.3□□□□□ -2.46
VID27P40157 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.35□□□□□ -2.47
VID27P40157 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.37□□□□□ -2.47
VID27P40157 YNL198CYNL198C 303 nt-0.37□□□□□ -2.47
VID27P40157 SEC10YLR166C 2616 nt-0.37□□□□□ -2.47
VID27P40157 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.39□□□□□ -2.47
VID27P40157 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.43□□□□□ -2.48
VID27P40157 URB1YKL014C 5295 nt-0.45□□□□□ -2.48
VID27P40157 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.49□□□□□ -2.49
VID27P40157 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.49□□□□□ -2.49
VID27P40157 YNL266WYNL266W 420 nt-0.51□□□□□ -2.49
VID27P40157 snR50snR50 90 nt-0.52□□□□□ -2.49
VID27P40157 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.53□□□□□ -2.49
VID27P40157 YBR178WYBR178W 375 nt-0.53□□□□□ -2.49
VID27P40157 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.54□□□□□ -2.5
VID27P40157 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.55□□□□□ -2.5
VID27P40157 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.55□□□□□ -2.5
VID27P40157 YGR151CYGR151C 336 nt-0.56□□□□□ -2.5
VID27P40157 YNL337WYNL337W 255 nt-0.56□□□□□ -2.5
VID27P40157 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.57□□□□□ -2.5
VID27P40157 YBL053WYBL053W 375 nt-0.57□□□□□ -2.5
VID27P40157 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.59□□□□□ -2.5
VID27P40157 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.59□□□□□ -2.5
VID27P40157 snR67snR67 82 nt-0.63□□□□□ -2.51
VID27P40157 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.66□□□□□ -2.52
VID27P40157 Q0032Q0032 291 nt-0.68□□□□□ -2.52
VID27P40157 YNL338WYNL338W 159 nt-0.7□□□□□ -2.52
VID27P40157 snR33snR33 183 nt-0.76□□□□□ -2.53
VID27P40157 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
VID27P40157 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
VID27P40157 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.78□□□□□ -2.53
VID27P40157 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.79□□□□□ -2.54
VID27P40157 YNR077CYNR077C 255 nt-0.86□□□□□ -2.55
VID27P40157 SKI7YOR076C 2244 nt-0.87□□□□□ -2.55
VID27P40157 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.88□□□□□ -2.55
VID27P40157 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.94□□□□□ -2.56
VID27P40157 snR161snR161 161 nt-0.94□□□□□ -2.56
VID27P40157 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.96□□□□□ -2.56
VID27P40157 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.08□□□□□ -2.58
VID27P40157 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.12□□□□□ -2.59
VID27P40157 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.13□□□□□ -2.59
VID27P40157 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.13□□□□□ -2.59
VID27P40157 YOR225WYOR225W 330 nt-1.13□□□□□ -2.59
VID27P40157 YLR294CYLR294C 330 nt-1.17□□□□□ -2.6
VID27P40157 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.17□□□□□ -2.6
VID27P40157 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.21□□□□□ -2.6
VID27P40157 RPL41AYDL184C 78 nt-1.22□□□□□ -2.6
VID27P40157 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.22□□□□□ -2.6
VID27P40157 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.26□□□□□ -2.61
VID27P40157 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.26□□□□□ -2.61
VID27P40157 snR81snR81 201 nt-1.3□□□□□ -2.62
VID27P40157 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.32□□□□□ -2.62
VID27P40157 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.34□□□□□ -2.62
VID27P40157 YNL170WYNL170W 396 nt-1.37□□□□□ -2.63
VID27P40157 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.39□□□□□ -2.63
VID27P40157 snR47snR47 99 nt-1.39□□□□□ -2.63
VID27P40157 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.41□□□□□ -2.64
VID27P40157 snR61snR61 90 nt-1.44□□□□□ -2.64
VID27P40157 snR38snR38 95 nt-1.44□□□□□ -2.64
VID27P40157 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.45□□□□□ -2.64
VID27P40157 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.48□□□□□ -2.65
VID27P40157 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.49□□□□□ -2.65
VID27P40157 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.5□□□□□ -2.65
VID27P40157 snR77snR77 88 nt-1.53□□□□□ -2.65
VID27P40157 ATP8Q0080 147 nt-1.54□□□□□ -2.66
VID27P40157 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.65□□□□□ -2.67
VID27P40157 YKL225WYKL225W 348 nt-1.66□□□□□ -2.68
VID27P40157 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.68□□□□□ -2.68
VID27P40157 snR62snR62 100 nt-1.74□□□□□ -2.69
VID27P40157 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.75□□□□□ -2.69
VID27P40157 Q0092Q0092 141 nt-1.86□□□□□ -2.71
VID27P40157 YOR309CYOR309C 381 nt-1.91□□□□□ -2.72
VID27P40157 Q0143Q0143 153 nt-1.92□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 129.6 ms