Protein–RNA interactions for Protein: P38844

DSE2, Protein DSE2, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2P38844 QCR9YGR183C 201 nt-0.15□□□□□ -2.43
DSE2P38844 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.16□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.16□□□□□ -2.44
DSE2P38844 snR69snR69 101 nt-0.17□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.17□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YOL014WYOL014W 375 nt-0.17□□□□□ -2.44
DSE2P38844 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.18□□□□□ -2.44
DSE2P38844 snR45snR45 172 nt-0.18□□□□□ -2.44
DSE2P38844 snR48snR48 113 nt-0.18□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.19□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.19□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YJL150WYJL150W 303 nt-0.19□□□□□ -2.44
DSE2P38844 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.21□□□□□ -2.44
DSE2P38844 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YBL053WYBL053W 375 nt-0.21□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.22□□□□□ -2.44
DSE2P38844 JLP2YMR132C 627 nt-0.22□□□□□ -2.44
DSE2P38844 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.23□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.23□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YNL198CYNL198C 303 nt-0.23□□□□□ -2.45
DSE2P38844 snR50snR50 90 nt-0.23□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.24□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.24□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YOR102WYOR102W 351 nt-0.24□□□□□ -2.45
DSE2P38844 SPG3YDR504C 384 nt-0.25□□□□□ -2.45
DSE2P38844 RDS3YPR094W 324 nt-0.25□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YNL266WYNL266W 420 nt-0.26□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YBR178WYBR178W 375 nt-0.26□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.27□□□□□ -2.45
DSE2P38844 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.27□□□□□ -2.45
DSE2P38844 SEC10YLR166C 2616 nt-0.29□□□□□ -2.46
DSE2P38844 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.29□□□□□ -2.46
DSE2P38844 YNL205CYNL205C 423 nt-0.29□□□□□ -2.46
DSE2P38844 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.29□□□□□ -2.46
DSE2P38844 RPM2YML091C 3609 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSE2P38844 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.3□□□□□ -2.46
DSE2P38844 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.31□□□□□ -2.46
DSE2P38844 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.33□□□□□ -2.46
DSE2P38844 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.36□□□□□ -2.47
DSE2P38844 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.37□□□□□ -2.47
DSE2P38844 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.39□□□□□ -2.47
DSE2P38844 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-0.4□□□□□ -2.47
DSE2P38844 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-0.4□□□□□ -2.47
DSE2P38844 snR67snR67 82 nt-0.41□□□□□ -2.48
DSE2P38844 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.41□□□□□ -2.48
DSE2P38844 SKI7YOR076C 2244 nt-0.42□□□□□ -2.48
DSE2P38844 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.42□□□□□ -2.48
DSE2P38844 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.42□□□□□ -2.48
DSE2P38844 YGR151CYGR151C 336 nt-0.44□□□□□ -2.48
DSE2P38844 YNL338WYNL338W 159 nt-0.44□□□□□ -2.48
DSE2P38844 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.49□□□□□ -2.49
DSE2P38844 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.5□□□□□ -2.49
DSE2P38844 URB1YKL014C 5295 nt-0.51□□□□□ -2.49
DSE2P38844 snR33snR33 183 nt-0.52□□□□□ -2.49
DSE2P38844 snR161snR161 161 nt-0.53□□□□□ -2.49
DSE2P38844 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.53□□□□□ -2.49
DSE2P38844 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.58□□□□□ -2.5
DSE2P38844 YNL337WYNL337W 255 nt-0.6□□□□□ -2.51
DSE2P38844 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
DSE2P38844 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
DSE2P38844 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
DSE2P38844 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.62□□□□□ -2.51
DSE2P38844 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.63□□□□□ -2.51
DSE2P38844 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.65□□□□□ -2.51
DSE2P38844 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.65□□□□□ -2.51
DSE2P38844 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
DSE2P38844 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.67□□□□□ -2.52
DSE2P38844 Q0032Q0032 291 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE2P38844 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
DSE2P38844 snR81snR81 201 nt-0.71□□□□□ -2.52
DSE2P38844 snR77snR77 88 nt-0.72□□□□□ -2.52
DSE2P38844 RPL41AYDL184C 78 nt-0.72□□□□□ -2.52
DSE2P38844 snR38snR38 95 nt-0.72□□□□□ -2.52
DSE2P38844 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.73□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.73□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.74□□□□□ -2.53
DSE2P38844 snR47snR47 99 nt-0.75□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
DSE2P38844 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YOR225WYOR225W 330 nt-0.77□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YLR294CYLR294C 330 nt-0.78□□□□□ -2.53
DSE2P38844 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.81□□□□□ -2.54
DSE2P38844 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.81□□□□□ -2.54
DSE2P38844 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.82□□□□□ -2.54
DSE2P38844 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.83□□□□□ -2.54
DSE2P38844 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.85□□□□□ -2.55
DSE2P38844 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.85□□□□□ -2.55
DSE2P38844 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.87□□□□□ -2.55
DSE2P38844 YNL170WYNL170W 396 nt-0.88□□□□□ -2.55
DSE2P38844 snR61snR61 90 nt-0.92□□□□□ -2.56
DSE2P38844 YKL225WYKL225W 348 nt-0.93□□□□□ -2.56
DSE2P38844 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.98□□□□□ -2.57
DSE2P38844 ATP8Q0080 147 nt-0.99□□□□□ -2.57
DSE2P38844 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.99□□□□□ -2.57
DSE2P38844 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.99□□□□□ -2.57
DSE2P38844 snR62snR62 100 nt-1.04□□□□□ -2.58
DSE2P38844 YOR309CYOR309C 381 nt-1.05□□□□□ -2.58
DSE2P38844 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.08□□□□□ -2.58
DSE2P38844 snR6snR6 112 nt-1.09□□□□□ -2.58
DSE2P38844 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms