Protein–RNA interactions for Protein: P36131

SPC34, DASH complex subunit SPC34, yeastyeast

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC34P36131 ORC3YLL004W 1851 nt0.56□□□□□ -2.32
SPC34P36131 FMP27YLR454W 7887 nt0.54□□□□□ -2.32
SPC34P36131 SBH1YER087C-B 249 nt0.54□□□□□ -2.32
SPC34P36131 YNL205CYNL205C 423 nt0.54□□□□□ -2.32
SPC34P36131 YBR099CYBR099C 384 nt0.54□□□□□ -2.32
SPC34P36131 YMR160WYMR160W 2451 nt0.54□□□□□ -2.32
SPC34P36131 STF2YGR008C 255 nt0.51□□□□□ -2.33
SPC34P36131 BUL2YML111W 2763 nt0.5□□□□□ -2.33
SPC34P36131 BIR1YJR089W 2865 nt0.49□□□□□ -2.33
SPC34P36131 PMP2YEL017C-A 132 nt0.46□□□□□ -2.34
SPC34P36131 YNL266WYNL266W 420 nt0.46□□□□□ -2.34
SPC34P36131 RCO1YMR075W 2055 nt0.44□□□□□ -2.34
SPC34P36131 EST1YLR233C 2100 nt0.44□□□□□ -2.34
SPC34P36131 YBR178WYBR178W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
SPC34P36131 MLP1YKR095W 5628 nt0.42□□□□□ -2.34
SPC34P36131 SEC10YLR166C 2616 nt0.42□□□□□ -2.34
SPC34P36131 snR69snR69 101 nt0.42□□□□□ -2.34
SPC34P36131 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.39□□□□□ -2.35
SPC34P36131 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.37□□□□□ -2.35
SPC34P36131 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.37□□□□□ -2.35
SPC34P36131 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.36□□□□□ -2.35
SPC34P36131 RPM2YML091C 3609 nt0.36□□□□□ -2.35
SPC34P36131 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
SPC34P36131 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.35□□□□□ -2.35
SPC34P36131 RDS3YPR094W 324 nt0.35□□□□□ -2.35
SPC34P36131 Q0143Q0143 153 nt0.34□□□□□ -2.36
SPC34P36131 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.34□□□□□ -2.36
SPC34P36131 IQG1YPL242C 4488 nt0.33□□□□□ -2.36
SPC34P36131 AI1Q0050 2505 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.32□□□□□ -2.36
SPC34P36131 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.29□□□□□ -2.36
SPC34P36131 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.28□□□□□ -2.36
SPC34P36131 snR85snR85 171 nt0.28□□□□□ -2.36
SPC34P36131 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.27□□□□□ -2.37
SPC34P36131 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.24□□□□□ -2.37
SPC34P36131 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.24□□□□□ -2.37
SPC34P36131 snR61snR61 90 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC34P36131 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC34P36131 snR50snR50 90 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC34P36131 THO2YNL139C 4794 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC34P36131 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC34P36131 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC34P36131 TFB5YDR079C-A 219 nt0.21□□□□□ -2.38
SPC34P36131 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC34P36131 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC34P36131 MLP2YIL149C 5040 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC34P36131 ESP1YGR098C 4893 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC34P36131 snR81snR81 201 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC34P36131 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC34P36131 YOL014WYOL014W 375 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC34P36131 snR128snR128 126 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC34P36131 SOV1YMR066W 2697 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC34P36131 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC34P36131 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.08□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YMR326CYMR326C 309 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC34P36131 snR67snR67 82 nt0.04□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.03□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.03□□□□□ -2.4
SPC34P36131 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC34P36131 YBL109WYBL109W 336 nt0.02□□□□□ -2.41
SPC34P36131 snR47snR47 99 nt0□□□□□ -2.41
SPC34P36131 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC34P36131 YHR217CYHR217C 462 nt-0.02□□□□□ -2.41
SPC34P36131 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.04□□□□□ -2.42
SPC34P36131 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.05□□□□□ -2.42
SPC34P36131 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.07□□□□□ -2.42
SPC34P36131 RPL41AYDL184C 78 nt-0.09□□□□□ -2.42
SPC34P36131 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.12□□□□□ -2.43
SPC34P36131 snR45snR45 172 nt-0.12□□□□□ -2.43
SPC34P36131 snR62snR62 100 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC34P36131 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC34P36131 SBH2YER019C-A 267 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC34P36131 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.14□□□□□ -2.43
SPC34P36131 SKI7YOR076C 2244 nt-0.15□□□□□ -2.43
SPC34P36131 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.23□□□□□ -2.45
SPC34P36131 snR38snR38 95 nt-0.23□□□□□ -2.45
SPC34P36131 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.25□□□□□ -2.45
SPC34P36131 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.27□□□□□ -2.45
SPC34P36131 YKL225WYKL225W 348 nt-0.28□□□□□ -2.45
SPC34P36131 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.35□□□□□ -2.47
SPC34P36131 snR161snR161 161 nt-0.41□□□□□ -2.48
SPC34P36131 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.42□□□□□ -2.48
SPC34P36131 snR64snR64 101 nt-0.45□□□□□ -2.48
SPC34P36131 URB1YKL014C 5295 nt-0.46□□□□□ -2.48
SPC34P36131 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC34P36131 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC34P36131 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.57□□□□□ -2.5
SPC34P36131 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC34P36131 snR33snR33 183 nt-0.69□□□□□ -2.52
SPC34P36131 snR53snR53 91 nt-0.69□□□□□ -2.52
SPC34P36131 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.7□□□□□ -2.52
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