Protein–RNA interactions for Protein: P35725

YKL063C, Uncharacterized protein YKL063C, yeast

Predictions only

Length 167 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	P35725	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
YKL063C	P35725	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
YKL063C	P35725	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
YKL063C	P35725	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	snR69	snR69	101 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
YKL063C	P35725	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	snR39B	snR39B	96 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YKL063C	P35725	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	snR80	snR80	171 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	snR48	snR48	113 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YKL063C	P35725	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YKL063C	P35725	snR161	snR161	161 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YKL063C	P35725	snR52	snR52	92 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YKL063C	P35725	snR50	snR50	90 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YKL063C	P35725	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YKL063C	P35725	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YKL063C	P35725	snR33	snR33	183 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YKL063C	P35725	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YKL063C	P35725	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YKL063C	P35725	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YKL063C	P35725	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YKL063C	P35725	YOR102W	YOR102W	351 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YKL063C	P35725	Q0142	Q0142	177 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YKL063C	P35725	snR67	snR67	82 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YKL063C	P35725	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YKL063C	P35725	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YKL063C	P35725	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
YKL063C	P35725	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YKL063C	P35725	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YKL063C	P35725	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YKL063C	P35725	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YKL063C	P35725	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
YKL063C	P35725	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
YKL063C	P35725	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YKL063C	P35725	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YKL063C	P35725	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YKL063C	P35725	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YKL063C	P35725	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
YKL063C	P35725	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
YKL063C	P35725	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
YKL063C	P35725	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
YKL063C	P35725	snR77	snR77	88 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
YKL063C	P35725	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
YKL063C	P35725	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
YKL063C	P35725	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
YKL063C	P35725	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
YKL063C	P35725	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
YKL063C	P35725	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
YKL063C	P35725	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
YKL063C	P35725	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
YKL063C	P35725	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
YKL063C	P35725	snR81	snR81	201 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
YKL063C	P35725	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
YKL063C	P35725	snR38	snR38	95 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
YKL063C	P35725	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
YKL063C	P35725	YNL337W	YNL337W	255 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
YKL063C	P35725	snR47	snR47	99 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
YKL063C	P35725	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YKL063C	P35725	Q0032	Q0032	291 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
YKL063C	P35725	YDR543C	YDR543C	300 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
YKL063C	P35725	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
YKL063C	P35725	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.03	□□□□□ -2.73
YKL063C	P35725	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
YKL063C	P35725	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
YKL063C	P35725	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.15	□□□□□ -2.75
YKL063C	P35725	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.19	□□□□□ -2.76
YKL063C	P35725	snR6	snR6	112 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
YKL063C	P35725	snR61	snR61	90 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
YKL063C	P35725	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.26	□□□□□ -2.77
YKL063C	P35725	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.33	□□□□□ -2.78
YKL063C	P35725	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
YKL063C	P35725	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
YKL063C	P35725	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.37	□□□□□ -2.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.3 ms