Protein–RNA interactions for Protein: P21372

PRP5, Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase PRP5, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP5P21372 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.47□□□□□ -2.17
PRP5P21372 FYV8YGR196C 2454 nt1.46□□□□□ -2.18
PRP5P21372 PET127YOR017W 2403 nt1.46□□□□□ -2.18
PRP5P21372 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.45□□□□□ -2.18
PRP5P21372 ULP2YIL031W 3105 nt1.42□□□□□ -2.18
PRP5P21372 SPT7YBR081C 3999 nt1.41□□□□□ -2.18
PRP5P21372 CSE1YGL238W 2883 nt1.41□□□□□ -2.18
PRP5P21372 UTP20YBL004W 7482 nt1.4□□□□□ -2.19
PRP5P21372 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.4□□□□□ -2.19
PRP5P21372 snR47snR47 99 nt1.39□□□□□ -2.19
PRP5P21372 DOP1YDR141C 5097 nt1.37□□□□□ -2.19
PRP5P21372 EST1YLR233C 2100 nt1.36□□□□□ -2.19
PRP5P21372 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.36□□□□□ -2.19
PRP5P21372 snR69snR69 101 nt1.35□□□□□ -2.19
PRP5P21372 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.33□□□□□ -2.2
PRP5P21372 YPR117WYPR117W 7470 nt1.33□□□□□ -2.2
PRP5P21372 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP5P21372 YOL014WYOL014W 375 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP5P21372 NIP1YMR309C 2439 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP5P21372 RDS3YPR094W 324 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP5P21372 ORC3YLL004W 1851 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP5P21372 RKR1YMR247C 4689 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP5P21372 BUL2YML111W 2763 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP5P21372 BUD3YCL014W 4911 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP5P21372 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP5P21372 NST1YNL091W 3723 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP5P21372 BEM2YER155C 6504 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP5P21372 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP5P21372 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP5P21372 YMR160WYMR160W 2451 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP5P21372 MYO1YHR023W 5787 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP5P21372 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP5P21372 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP5P21372 snR64snR64 101 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP5P21372 SCC2YDR180W 4482 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP5P21372 YJR029WYJR029W 5268 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP5P21372 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP5P21372 VAM6YDL077C 3150 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP5P21372 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.09□□□□□ -2.23
PRP5P21372 snR53snR53 91 nt1.09□□□□□ -2.23
PRP5P21372 RPL41AYDL184C 78 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP5P21372 YKL225WYKL225W 348 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP5P21372 snR50snR50 90 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP5P21372 PET111YMR257C 2403 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP5P21372 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP5P21372 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
PRP5P21372 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP5P21372 LTE1YAL024C 4308 nt0.98□□□□□ -2.25
PRP5P21372 AI1Q0050 2505 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP5P21372 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP5P21372 snR38snR38 95 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP5P21372 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP5P21372 FMP27YLR454W 7887 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP5P21372 SKI7YOR076C 2244 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP5P21372 snR67snR67 82 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP5P21372 MLP1YKR095W 5628 nt0.79□□□□□ -2.28
PRP5P21372 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.79□□□□□ -2.28
PRP5P21372 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP5P21372 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.77□□□□□ -2.29
PRP5P21372 UTP10YJL109C 5310 nt0.73□□□□□ -2.29
PRP5P21372 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.73□□□□□ -2.29
PRP5P21372 IQG1YPL242C 4488 nt0.73□□□□□ -2.29
PRP5P21372 THO2YNL139C 4794 nt0.73□□□□□ -2.29
PRP5P21372 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
PRP5P21372 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
PRP5P21372 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.64□□□□□ -2.31
PRP5P21372 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.63□□□□□ -2.31
PRP5P21372 MLP2YIL149C 5040 nt0.59□□□□□ -2.32
PRP5P21372 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP5P21372 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP5P21372 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP5P21372 SOV1YMR066W 2697 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP5P21372 snR128snR128 126 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP5P21372 PAU9YBL108C-A 129 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP5P21372 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.36□□□□□ -2.35
PRP5P21372 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
PRP5P21372 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
PRP5P21372 snR75snR75 89 nt0.31□□□□□ -2.36
PRP5P21372 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.29□□□□□ -2.36
PRP5P21372 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.2□□□□□ -2.38
PRP5P21372 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.18□□□□□ -2.38
PRP5P21372 SBH2YER019C-A 267 nt0.14□□□□□ -2.39
PRP5P21372 snR77snR77 88 nt0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms