Protein–RNA interactions for Protein: P00927

ILV1, Threonine dehydratase, mitochondrial, yeast

Known RBP Predictions only

Length 576 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ILV1	P00927	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
ILV1	P00927	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
ILV1	P00927	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
ILV1	P00927	snR69	snR69	101 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
ILV1	P00927	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	snR33	snR33	183 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
ILV1	P00927	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	snR39B	snR39B	96 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	snR50	snR50	90 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
ILV1	P00927	snR48	snR48	113 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
ILV1	P00927	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
ILV1	P00927	snR80	snR80	171 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
ILV1	P00927	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	snR52	snR52	92 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	snR161	snR161	161 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
ILV1	P00927	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
ILV1	P00927	snR67	snR67	82 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
ILV1	P00927	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
ILV1	P00927	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
ILV1	P00927	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
ILV1	P00927	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
ILV1	P00927	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
ILV1	P00927	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	Q0142	Q0142	177 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	snR77	snR77	88 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
ILV1	P00927	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
ILV1	P00927	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
ILV1	P00927	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
ILV1	P00927	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
ILV1	P00927	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
ILV1	P00927	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
ILV1	P00927	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
ILV1	P00927	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
ILV1	P00927	snR81	snR81	201 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
ILV1	P00927	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
ILV1	P00927	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
ILV1	P00927	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
ILV1	P00927	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
ILV1	P00927	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
ILV1	P00927	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
ILV1	P00927	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
ILV1	P00927	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
ILV1	P00927	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
ILV1	P00927	snR38	snR38	95 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
ILV1	P00927	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
ILV1	P00927	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
ILV1	P00927	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
ILV1	P00927	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
ILV1	P00927	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
ILV1	P00927	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
ILV1	P00927	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
ILV1	P00927	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
ILV1	P00927	snR6	snR6	112 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
ILV1	P00927	snR47	snR47	99 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
ILV1	P00927	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
ILV1	P00927	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
ILV1	P00927	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
ILV1	P00927	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.89	□□□□□ -2.71
ILV1	P00927	snR73	snR73	106 nt		-1.93	□□□□□ -2.72
ILV1	P00927	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-1.97	□□□□□ -2.72
ILV1	P00927	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.98	□□□□□ -2.73
ILV1	P00927	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
ILV1	P00927	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
ILV1	P00927	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
ILV1	P00927	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
ILV1	P00927	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
ILV1	P00927	Q0032	Q0032	291 nt		-2.12	□□□□□ -2.75
ILV1	P00927	snR85	snR85	171 nt		-2.2	□□□□□ -2.76
ILV1	P00927	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-2.21	□□□□□ -2.76
ILV1	P00927	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
ILV1	P00927	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-2.25	□□□□□ -2.77
ILV1	P00927	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.27	□□□□□ -2.77

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