Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms