Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt27Q9Z320 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt27Q9Z320 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt27Q9Z320 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt27Q9Z320 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt27Q9Z320 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt27Q9Z320 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt27Q9Z320 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms