Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T1

Kcnk7, Potassium channel subfamily K member 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk7Q9Z2T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnk7Q9Z2T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnk7Q9Z2T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kcnk7Q9Z2T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnk7Q9Z2T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnk7Q9Z2T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnk7Q9Z2T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.5 ms