Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd4Q9Z2D7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd4Q9Z2D7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd4Q9Z2D7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd4Q9Z2D7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd4Q9Z2D7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd4Q9Z2D7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms