Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rps6ka4Q9Z2B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rps6ka4Q9Z2B9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms