Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stk39Q9Z1W9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stk39Q9Z1W9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stk39Q9Z1W9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stk39Q9Z1W9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Stk39Q9Z1W9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stk39Q9Z1W9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stk39Q9Z1W9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stk39Q9Z1W9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stk39Q9Z1W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stk39Q9Z1W9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stk39Q9Z1W9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stk39Q9Z1W9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms