Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sh3bp5Q9Z131 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sh3bp5Q9Z131 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp5Q9Z131 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh3bp5Q9Z131 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sh3bp5Q9Z131 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3bp5Q9Z131 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms